يقع بعض الاشخاص في خطأ عند تناول بذور الشيا وعلى الرغم من انها مفيدة، ولكن هناك أخطاء شائعة يجب تجنبها لضمان الاستفادة الكاملة منها وتجنب أي أضرار ومن بين هذه الأخطاء: تناولها جافة، الإفراط في الكمية، عدم نقعها أو طحنها، تناولها مع أطعمة معينة، وإضافتها إلى أطعمة غير صحية وأول خطأ شائع هو تناول بذور الشيا جافة دون نقعها، وهذا من أخطر ما يمكن فعله،حيث تمتص البذور ما يصل إلى 10 أضعاف وزنها من السوائل، وعند تناولها جافة قد تتورم داخل المريء أو المعدة ما يؤدي إلى عسر بلع أو اضطرابات هضمية شديدة، وقد تصل في بعض الحالات إلى انسداد جزئي في الجهاز الهضمي، خاصة لدى الأشخاص الذين يعانون من مشكلات في البلع.

وثاني خطأ هو الإفراط في الكمية، فالبعض يعتقد أن الكمية الأكبر تعني فوائد أكثر، وهذا غير دقيق، فبذور الشيا غنية بالألياف، والزيادة المفرطة فيها قد تسبب انتفاخات، إسهال أو إمساك شديد، خاصة إذا لم يشرب معها كمية كافية من الماء معها، والجرعة اليومية المناسبة عادة لا تتجاوز 20 جرامًا أو ملعقتين كبيرتين،فالأعتدال في التناول امر هام بشكل بالغ حتى لا تؤدي الى نتيجة عكسية.

ويحذر أيضًا الخبراء المختصون من تناول الشيا دون طحنها أو نقعها إذا كان الهدف منها هو الحصول على أحماض أوميجا 3، موضحًا أن القشرة الخارجية لبذور الشيا لا تُكسر بسهولة داخل الجسم، وهو ما يمنع امتصاص بعض العناصر الغذائية مثل أوميجا 3، لذا يُنصح إما بطحنها أو نقعها جيدًا لتسهيل امتصاص هذه الدهون المفيدة داخل جسم الأنسان.

كمان أن هناك بعض الأشخاص وفئات معينة من المحظور تناولهم لبذور الشيا وهما،مرضى اضرابات الجهاز الهضمي المزمنة ومرضى القلب الذين يتناولون أدوية لسيولة الدم حيث قد تتداخل التأثيرات وتحدث مضاعفات.

وعدم تناولها مع الحمضيات مثل البرتقال والليمون حيث قد تسبب عند امتزاجها بالحمضيات انتفاخًا أو ارتجاعًا لدى البعض لذلك يفضل تناولها مع فواكهه خفيفة كالموز والتفاح.